یکی از روشها استفاده از pgf/TikZ است. در این لینک همان سوال شما رو جواب داده است...
http://tex.stackexchange.com/questions/1449/how-can-should-i-include-annotated-images
این هم یک مثال...
http://kogs-www.informatik.uni-hamburg.de/~meine/tikz/
http://tex.stackexchange.com/questions/1449/how-can-should-i-include-annotated-images
این هم یک مثال...
http://kogs-www.informatik.uni-hamburg.de/~meine/tikz/