روش قبلی برای خود من هم کار نکرد ولی به روش دیگه xindy رو روی میکتک ۲.۸ نصب کردم و استفاده کردم. باید ابتدا دو فایل tlperl.7z و xindy-miktex.rar رو از مرکز دانلود سایت دریافت کنید و آنها را در دایرکتوری میکتک خود باز کنید. سپس دایرکتوری bin پوشه tlperl رو به مسیر ویندوز اضافه کنید. روی سیستم من میکتک در C:\texmf نصب است (و به شما هم توصیه میکنم همین کار رو بکنید) اگر روی سیستم شما در جای دیگر نصب است باید فایل texmf.cnf واقع در دایرکتوری miktex خود را با یک ویرایشگر باز کنید و در خط ۴۰ به جای
MIKTEXMAIN = C:/texmf
مسیر درست روی سیستم خود را قرار دهید. به پیوست حاصل پردازش xindy روی نمایه جزوه توپولوژی من را میبینید.