در گزینههای بارگزاری کلاس scrbook در فایل کلاس، گزینه زیر را اضافه کنید،
chapterprefix=true
نمیدانم چرا وقتی این گزینه را در خود فایل اصلی تک و به عنوان گزینه کلاس thesis میگذارم، جواب نمیگیرم. حتما مشکلی در پاس کردن گزینههای دیگر به کلاس کمااسکریپت است.