پس مشکل مشخص شد.
اولا جهت اطلاع عرض کنم که وقتی با Adobe یک فایل پی دی اف رو باز میکنید، اصطلاحا اون فایل رو حفاظت یا پروتکت میکنه تا برنامه دیگری تغییرش نده. این در حالی است که وقتی شما فایلتان را پردازش میکنید، لازم است که فایل قبلی پاک شده و خروجی جدید نوشته بشه. به همین دلیل اساسا استفاده از adobe توصیه نمیشه.
در مورد مشکل شما هم عرض کنم که من تا حالا ندیدم که adobe با هیچ ادیتوری مرتبط باشه. یعنی بشه از فایل پی دی اف به فایل اصلی و برعکس رفت. شاید دوستان تجربه تنظیم آنرا داشته باشند ولی من ندیدم.
و اما راه حل همان سوماترا هست که هر دو مسإله فوق را حل میکند.